【Gromacs】因为gromacs必须安装cuda(系统自带的NVIDIA驱动不行),这里介绍下如何安装cuda
1. 安装步骤查看是否安装了cuda# 法1 cat /usr/local/cuda/version.txt# 法2 nvcc --version若没有安装则查看是否有N卡驱动若无N卡驱动则到软件与更新 - 附加驱动中安装驱动查看N卡驱动支持的cuda版本nvidia-smi如下图支持最高CUDA版本是11.42. 到cuda-toolkit-archive选择需要的CUDA下载CUDA Toolkit 11.4 Downloads | NVIDIA Developer2.1如下图选择runfile(local)并使用生成的指令进行下载和安装2.2若第1步提示Existing package manager installation of the driver found. It is strongly recommended that you remove this before continuing.选择continue然后下一步输入accept再下一步中去除driver项之后选择install2.2.1.选择continue2.2.2.输入accept2.2.3.取消Driver、然后选择Install敲击空格取消Driver设置前设置后3. 在~/.bashrc文件中添加如下环境变量export PATH/usr/local/cuda-11.4/bin${PATH::${PATH}} export LD_LIBRARY_PATH/usr/local/cuda-11.4/lib64${LD_LIBRARY_PATH::${LD_LIBRARY_PATH}}然后 source ~/.bashrc 更新激活环境4.验证是否安装成功nvcc -V5、cudnn安装网址cuDNN Archive | NVIDIA DevelopercuDNN Archive | NVIDIA Developer因为cuda是11.8所以选择对应的cudnn我选择的8.5下载 tar格式tar -xvf cudnn-linux-x86_64-8.5.0.96_cuda11-archive.tar.xz sudo cp cuda/include/cudnn*.h /usr/local/cuda/include sudo cp -P cuda/lib64/libcudnn* /usr/local/cuda/lib64 sudo chmod ar /usr/local/cuda/include/cudnn*.h #JJ根据对应的文件路径修改下路径验证cat /usr/local/cuda/include/cudnn_version.h | grep CUDNN_MAJOR -A 2出现以下信息说明安装成功

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