多组学之互作组—RNA结合蛋白

1RBP概述RNA结合蛋白RBPs在转录后基因表达调控过程中起着十分重要的作用。包括RNA的加工加帽、可变剪接、加polyA、RNA编辑、RNA修饰、RNA定位、翻译和降解等过程。在人类生命活动中RBP的失效会导致癌症、代谢疾病和神经退行性疾病等。在植物中RBPs也是重要的调控因子涉及到胚珠发育、花的发育、生物时钟、胁迫响应和免疫反应等。典型的RBP-RNA互作是通过RNA结合域RBDs, 如KH域、DEAD域、DSRM域等来实现的。研究发现人类一半的RBPs缺乏保守的RBDs。迄今为止在人类已发现1914个RBPs【1】。2RBP鉴定方法目前主要采用RICK实验方法来发现新的RBPsRICK方法通过5-EU标记新生RNA→加生物素→链霉亲和素富集的策略无偏向性地鉴定所有RNA类型包括非poly(A) RNA结合的RBPs显著拓展了RNA相互作用组的研究范围【2】。3参考文献1、Gerstberger, Stefanie, Markus Hafner, and Thomas Tuschl. A census of human RNA-binding proteins. Nature Reviews Genetics 15, no. 12 (2014): 829-845.2、Bao, Xichen, Xiangpeng Guo, Menghui Yin, Muqddas Tariq, Yiwei Lai, Shahzina Kanwal, Jiajian Zhou et al. Capturing the interactome of newly transcribed RNA. Nature methods 15, no. 3 (2018): 213-220.